Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhocQ62159 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhocQ62159 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms