Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms