Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nfe2l1Q61985 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nfe2l1Q61985 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nfe2l1Q61985 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nfe2l1Q61985 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nfe2l1Q61985 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfe2l1Q61985 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms