Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm1Q61937 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms