Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms