Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd1Q61345 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms