Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Irgm1Q60766 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irgm1Q60766 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms