Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms