Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgaeQ60677 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms