Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms