Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl17Q5UW37 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cxcl17Q5UW37 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cxcl17Q5UW37 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cxcl17Q5UW37 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cxcl17Q5UW37 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cxcl17Q5UW37 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cxcl17Q5UW37 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cxcl17Q5UW37 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cxcl17Q5UW37 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl17Q5UW37 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms