Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms