Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms