Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3kQ5GIG6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3kQ5GIG6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms