Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zc3h12aQ5D1E7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms