Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms