Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdv3Q4VAA2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms