Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms