Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trp53i11Q4QQM4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms