Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syne3Q4FZC9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms