Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms