Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms