Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms