Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garnl3Q3V0G7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms