Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms