Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms