Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms