Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms