Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms