Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc4Q3UP24 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms