Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cog7Q3UM29 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms