Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BtrcQ3ULA2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BtrcQ3ULA2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms