Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms