Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod2Q3UHZ5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod2Q3UHZ5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms