Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Parp8Q3UD82 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms