Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms