Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms