Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms