Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms