Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms