Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TraddQ3U0V2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms