Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl4Q3TZA2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl4Q3TZA2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms