Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms