Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dcaf17Q3TUL7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dcaf17Q3TUL7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms