Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3TTL0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms