Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TQQ9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms