Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms