Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms