Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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