Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm1Q2TV84 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm1Q2TV84 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms